Las operaciones de reasignación de sexo no están indicadas en pacientes con problemas cardiovasculares, circulatorios, urológicos; tampoco está recomendada en personas con trastornos psicológicos o psiquiátricos. El cirujano evaluará la historia clínica del paciente, sus antecedentes personales, enfermedades preexistentes o recientes, por esto la realización o no de la intervención se decidirá en función de cada paciente de manera individual.